Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE5

OPALIN, Opalin, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPALINQ96PE5 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
OPALINQ96PE5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms