Protein–RNA interactions for Protein: Q96LX7

CCDC17, Coiled-coil domain-containing protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC17Q96LX7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CCDC17Q96LX7 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms