Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
RNF185Q96GF1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.8 ms