Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC6

ZNF274, Neurotrophin receptor-interacting factor homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF274Q96GC6 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF274Q96GC6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms