Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LTV1Q96GA3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms