Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SIRT1Q96EB6 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms