Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
MTERF3Q96E29 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms