Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NXNL1Q96CM4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NXNL1Q96CM4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms