Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ZNF428Q96B54 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ZNF428Q96B54 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms