Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GTF3AQ92664 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GTF3AQ92664 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms