Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 KDELC2-201ENST00000323468 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
BRK1Q8WUW1 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EPB41L1-202ENST00000338074 6266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 MYO16-205ENST00000457511 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SLC29A1-201ENST00000371708 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CIC-204ENST00000572681 8218 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DGKD-202ENST00000409813 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 EPRS-201ENST00000366923 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TRABD2B-202ENST00000606738 7034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 FBN1-201ENST00000316623 11756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
BRK1Q8WUW1 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms