Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
FAT3Q8TDW7 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
FAT3Q8TDW7 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms