Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC4Q8TBB5 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC4Q8TBB5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms