Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HELBQ8NG08 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HELBQ8NG08 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms