Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
C9orf106Q8NAJ2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
C9orf106Q8NAJ2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms