Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SMIM20Q8N5G0 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SYDE1-201ENST00000342784 3264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.38□□□□□ -0.59
SMIM20Q8N5G0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
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