Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
C9orf62Q8N4C0 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C9orf62Q8N4C0 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms