Protein–RNA interactions for Protein: Q86V59

PNMA8A, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8AQ86V59 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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PNMA8AQ86V59 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PNMA8AQ86V59 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PNMA8AQ86V59 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
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