Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
UBE3BQ7Z3V4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
UBE3BQ7Z3V4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms