Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
BHLHA9Q7RTU4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
BHLHA9Q7RTU4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms