Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RUFY3Q7L099 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RUFY3Q7L099 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms