Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
USP31Q70CQ4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
USP31Q70CQ4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
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