Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PAXIP1Q6ZW49 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PAXIP1Q6ZW49 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms