Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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C9orf139Q6ZV77 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
C9orf139Q6ZV77 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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