Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRZ4

C9orf47, Uncharacterized protein C9orf47, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf47Q6ZRZ4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
C9orf47Q6ZRZ4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
C9orf47Q6ZRZ4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms