Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SUSD1Q6UWL2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SUSD1Q6UWL2 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms