Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
DUX4L9Q6RFH8 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
DUX4L9Q6RFH8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.7 ms