Protein–RNA interactions for Protein: Q6PII3

CCDC174, Coiled-coil domain-containing protein 174, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC174Q6PII3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CCDC174Q6PII3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC174Q6PII3 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms