Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9F0

CCDC62, Coiled-coil domain-containing protein 62, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC62Q6P9F0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC62Q6P9F0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC62Q6P9F0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC62Q6P9F0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC62Q6P9F0 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC62Q6P9F0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CCDC62Q6P9F0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC62Q6P9F0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms