Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC41PQ6P2S7 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC41PQ6P2S7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms