Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF7

APOBEC3H, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3H, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3HQ6NTF7 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
APOBEC3HQ6NTF7 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
APOBEC3HQ6NTF7 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms