Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDGFL1Q5TGJ6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms