Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TTC39AQ5SRH9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TTC39AQ5SRH9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms