Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ODF2Q5BJF6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ODF2Q5BJF6 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.2 ms