Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ALFQ53S48 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
ALFQ53S48 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms