Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB6CQ53S08 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB6CQ53S08 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms