Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CDCA8Q53HL2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDCA8Q53HL2 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms