Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMEM259Q4ZIN3 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms