Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CCDC96Q2M329 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms