Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
RRN3P1Q2M238 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms