Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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CCDC142Q17RM4 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
CCDC142Q17RM4 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
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