Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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CDO1Q16878 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CDO1Q16878 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
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