Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
UPP1Q16831 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
UPP1Q16831 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms