Protein–RNA interactions for Protein: Q16822

PCK2, Phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial, humanhuman

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Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCK2Q16822 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PCK2Q16822 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms