Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ATP2B3Q16720 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATP2B3Q16720 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
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