Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 FABP5-201ENST00000297258 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AL135787.1-201ENST00000450154 302 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC246787.1-201ENST00000392301 627 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC092925.1-201ENST00000470739 493 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AIRN-202ENST00000609176 1489 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 KRTAP4-1-201ENST00000398472 1241 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AP003716.1-203ENST00000533670 613 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 KRTAP4-1-202ENST00000620667 737 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
FOXD1Q16676 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FOXD1Q16676 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
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