Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CSRP2Q16527 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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