Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
CNGA3Q16281 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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