Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
USF2Q15853 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PRKY-203ENST00000528056 7218 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
USF2Q15853 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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