Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMGN3Q15651 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
HMGN3Q15651 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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